《我是刑警》昀城溪城警方的侦查思路不同，破案涉及到两地管辖权的问题，两地警方坚持各自调查，不愿并案，这种各自为政的工作方式导致了案件调查的僵局，使得案件难以取得突破。
张克寒在昀城犯下两起银行抢劫案，并抢走部队哨兵的枪支。省厅专家组将这三起案件合并调查，并在昀城展开大规模搜捕。张克寒逃至溪城，在郊野公园绘制路线图时，遭遇农民李卫国，将其连开八枪杀害。一名摄影爱好者目击案发经过并报警。2009年10月14日上午10点20分，溪城市局刑侦支队接到报案并赶往现场。弹道测试结果显示，昀城和溪城的命案系同一枪支所为。省厅专家武英德认定两案系系列案件，并再次提出并案调查，但溪城警方以两案性质不同为由拒绝配合。
溪城市公安局副局长顾保雄认为两案关联性不大，尤其昀城案为抢劫，而李卫国案无财物损失，主张先侦破李卫国枪杀案。武英德和他的同事曹忠恕、赵飞则怀疑张克寒在附近银行踩点，李卫国意外撞见而被灭口。但顾保雄坚持己见，拒绝并案。 尽管曹忠恕、赵飞和武英德极力游说，顾保雄仍不松口，三人无奈离开溪城。
武英德心事重重，将溪城案件视为心头大石。秦川对其劝慰，武英德甚至恳求秦川接手此案，认为跨部门合作机制的缺失是导致犯罪嫌疑人屡屡逃脱的关键，并表示如果不破案将死不瞑目。秦川表示将认真考虑此事。
《我是刑警》精彩剧情介绍 第11集：秦川通过血指纹查出真凶
秦川即将前往绪城刑侦支队报到，临行前与好友胡兵道别。
秦川和肖庆东到绪城报到后，与曹忠恕成为邻居。
绪城市公安局东萍县公安局局长董振发请秦川协助侦办一起五年前的杀人案。
秦川和肖庆东到现场调查，认为这是一起激情杀人案，但当地警方对此存疑。
东萍刑侦大队大队长周勇交代了此案的进展，称警方怀疑高鹏报复杀人，但缺乏证据。
秦川从头审阅案卷，发现警方采集了一枚血指纹，但未进行鉴定。
周勇和董振发支支吾吾，秦川要求他们说出实情。
周勇拿出副卷，里面有血指纹，但警方以指纹复杂为由拒绝鉴定。
秦川带走所有证据和卷宗，并决心查明真相。
魏宁劝说秦川不要插手此案，担心他费力不讨好。
秦川坚持破案以平民愤，魏宁带他去探望曹忠恕的妻子，她患有阿尔兹海默症。
曹忠恕仔细比对血指纹，发现特征稳定性不够，无法鉴定。
秦川和何青莲得知曹忠恕妻子的病情，何青莲前往陪伴。
曹忠恕的团队完成图像分析系统，再次测试血指纹。
测试结果发现七个显著特征，与高鹏的指纹不符，排除了他的嫌疑。
秦川和肖庆东连夜前往东萍，怀疑当地警方有所隐瞒。
秦川召开紧急会议，要求调查取证，并强调务必给丁丽关系密切的人留指纹。
周勇调查发现丁丽与祖洋关系密切，并提取了他的指纹。
比对结果显示祖洋嫌疑最大，但仍需进一步证据。
秦川亲自前往东萍采集祖洋的指纹，曹忠恕也随后赶到。
比对结果确定祖洋就是真凶，但证据不足以定罪。
周勇找到祖洋带血的T恤，让其妻子辨认。
祖洋妻子证实T恤属于祖洋，秦川要求周勇找到一件衣服让祖洋试穿，以便采集DNA样本。